秋冬季节气温变化大，是兔瘟、巴氏杆菌、波氏杆菌、魏氏杆菌等烈性传染病高发阶段，所以要认真搞好以上疾病的防疫工作。一般断奶以上，不分大、小兔子，每只兔子皮下注射兔瘟蜂胶苗1毫升以上或者兔瘟普通疫苗2毫升，也可以用兔瘟、巴氏、魏氏三联苗每只皮下注射2毫升以上。
一、搞好兔舍消毒和环境卫生。定期对兔舍、食具和笼具洗刷消毒。早晚做好保暖工作，保持空气流通。不喂带露水的草。
二、抓紧注射疫苗。秋季防疫适用疫苗主要有以下几种：1、兔瘟疫苗：目前使用的组织灭活苗效果较好。每只皮下注射1毫升，5~7天可产生很强的免疫力，免疫期达6个月。2、兔瘟巴氏杆菌二联苗：每只皮下注射1毫升，可以在半年内免受兔瘟侵染，4个月内免受巴氏杆菌侵染。 3、A型魏氏梭菌灭活菌苗：每只皮下注射2毫升，保护期半年。这种菌苗可以防治因A型魏氏梭菌引起的家兔腹泻病。4、巴氏杆菌波氏杆菌伪结核杆菌灭活菌苗：每只皮下注射1毫升，保护期半年。注射疫苗,一定要按要求进行，注射剂量要足、部位要准，每注射1只兔更换1次针头。春季已免疫的，秋季也必须再次免疫。
三、预防球虫病。成年家兔球虫感染率较低，幼兔感染率较高。断奶前后的幼兔感染球虫后，死亡率很高。防治家兔球虫病的常用药有氯苯胍、兔球灵、克球灵、磺胺二甲基嘧啶等。使用抗球虫药时，注意使用方法和用药量，以防发生药物中毒等意外情况。